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武光一朝長期內亂，國內軍閥四起，盤距一方彼此爭鬥，然而長久以來從未有一個軍閥成功擊敗所有敵手，成為武光霸主，因此武光朝的百姓生活十分困苦，雖然不至於因為戰亂而喪生，卻也沒有過過一天好日子。
林慕元是天和門的弟子，醫術了得被尊為神醫，因幼時四處流離的經歷立志行醫天下，救治百姓進而促使武光恢復和平。在他即將出師，準備入世救助百姓之際，他的師父──牽機長老卻將他派往臨淵軍軍營協助。他討厭讓人民受難的戰爭，討厭軍隊，卻因為師父的小手段而不得不加入臨淵軍，協助臨淵軍的大將軍墨瀾平取得天下。
臨淵軍是武光朝中的軍閥之一，不過和其他軍閥不同，是一支會保護領地百姓、照顧百姓生活的仁義之師，天和門因此十分看重臨淵軍，和臨淵軍維持著合作關係。此時，臨淵軍的勢力已是武光朝中數一數二的大軍閥，為了能夠增加臨淵軍的力量，使其統一武光的軍閥，天和門便決定派出神醫林慕元，希望他能用醫術幫助臨淵軍減少損失，更加壯大。
在軍營相處沒多久，墨瀾平被林慕元的志向吸引，對他產生了愛慕之情。不過鑒於戰亂未止，以及他可能隨時喪命的危險，他並沒有追求林慕元或是向他表明心意。後來林慕元雖然自己察覺了墨瀾平的心意，但是林慕元對情感一事遲鈍，也從未想過與人相愛之事，兩人的關係便一直維持著微妙的距離。
在經過幾次戰爭，並和武光最大的軍閥──畢將軍對陣過後，墨瀾平和林慕元終於慢慢發現了武光一朝內亂不止的秘密。
知道了武光的秘密之後，墨瀾平和林慕元決定潛入都城，解除陰謀還百姓一個和平盛世。不過，都城的危險不輸戰場，兩人在其中和貴族鬥智鬥勇，耗費了不少心力，也因此徹底了武光內亂背後的陰謀。知道陰謀的始末後，墨瀾平說服了一些貴族協助他發起叛變，準備闖入皇宮中。
在墨瀾平率領眾衛兵來到皇城和武光貴族之首──馬大人對峙的同時，林慕元也在另一處盡己所能的幫助墨瀾平，兩人並沒有事先計畫好，僅憑著為對方付出的心，協力破除了馬大人長久以來的陰謀（順便知道了武光朝另外一個秘密），並和天和門一起重新建立國家制度。
家國危機雖然解除，但是馬大人垂死掙扎，在林慕元身上施加了新的咒術。為了能和林慕元在往後的日子裡攜手相伴，墨瀾平不得不和林慕元一起再次踏上旅途……。